内设股室：办公室、预算股(国库股)（政府性债务管理办公室）、行财股、社保股、农业股、经建股、综合股(企业股)、会计股(行政审批股)、农村财政管理股(农村综合改革工作办公室)、金融监管股、国有资产监督管理股；

二级机构：会计中心（国库支付中心）、非税收入管理服务中心

股级事业单位：财政监督评价中心（政府采购中心、预算绩效评价中心合署办公）、中小企业融资担保中心、县信息中心、绩溪县政府和社会资本合作服务中心、绩溪县金融发展和上市企业服务中心